Мать-и-мачеха в Новосибирске
Аннотация «фенология растений» для меня очень полезна. С её помощью я, например, узнаю, когда у нас цветёт то или иное растение, или как выглядит его плод. В этом году также появилась аннотация для листьев, и мне захотелось увидеть на графике дуальность мать-и-мачехи (Tussilago farfara), которая, как хорошо известно, сначала цветёт, а лишь затем выпускает листья.
Наблюдения
В Новосибирской области на текущий момент (28.07.2024) сделано 689 наблюдений мать-и-мачехи. При этом загружено всего 53 наблюдения, сделанных до 2020 года. Начиная с 2020 года делается 100–150 наблюдений в год.
Аннотирована при этом была лишь малая их часть. Спасибо тем наблюдателям, которые добавляют аннотации к своим наблюдениям! Остальные я разметил самостоятельно, благо на это ушла пара часов. Что касается аннотации листьев, то технически чешуйки на цветоносе это тоже листья, но мне кажется, что в данном случае полезнее отделить фазу цветения от вегетативной фазы. Как компромисс, никак не аннотировал листья на цветущих растениях.
Теперь немного статистики по наблюдениям. Ожидаемо, чаще всего фотографируют цветы (74% наблюдений), а остальные фазы не пользуются такой популярностью. Очень мало фотографий плодоносящих растений.
| Фенология | Наблюдений |
|---|---|
| Бутоны | 44 |
| Цветы | 513 |
| Плоды | 46 |
| Листья | 113 |
Отдельные интересные наблюдения:
- это наблюдение от @onotole содержит микроскопию пыльцы;
- а в этом от @smertin-roman кроме цветов есть хороший мальчик (а может быть девочка).
Наблюдатели
Узнаем предпочтения самых активных наблюдателей. Интересно, что разные наблюдатели предпочитают разные фазы (или просто активны в разное время года?).
Цветы
| № | Наблюдатель | Наблюдений |
|---|---|---|
| 1 | @valentin_kosterin | 62 |
| 2 | @oleg_kosterin | 50 |
| 3 | @alzov | 29 |
| 4 | @tatyanapopova | 27 |
| 5 | @kildor | 26 |
| 6 | @mariya_marenina | 18 |
| 7 | @marinavs | 17 |
Плоды
| № | Наблюдатель | Наблюдений |
|---|---|---|
| 1 | @alzov | 12 |
| 2 | @pavel100 | 4 |
| 2 | @kildor | 4 |
| 4 | @valentin_kosterin | 3 |
| 4 | @tatyanapopova | 3 |
| 6 | @sbasalaev | 2 |
| 6 | @oleg_kosterin | 2 |
| 6 | @tatyana_kolesnikova | 2 |
| 6 | @oksana_serikova | 2 |
Листья
| № | Наблюдатель | Наблюдений |
|---|---|---|
| 1 | @alzov | 13 |
| 2 | @tatyanapopova | 11 |
| 3 | @romanguscha | 10 |
| 4 | @mariya_marenina | 9 |
| 5 | @veronika_belova | 8 |
| 6 | @alexanderdubynin | 5 |
| 7 | @kildor | 4 |
Фенология
Попробуем извлечь из данных какую-нибудь пользу помимо соревновательной. Вначале я хотел разбить фенологию по годам, поскольку весна год от года разная. Но в реальности за последние 4 года картина примерно одинаковая данных недостаточно, чтобы ощутить разницу. Кроме того, основная масса наблюдений сделана в период цветения, и данных в остальные месяцы очень мало.
Наблюдения, рассортированные по фенологии:
Нормированные данные:
Видим, что лучшее время наблюдения за цветами — середина и конец апреля, за плодами — середина мая. Хороших наблюдений!
評論
Интересное исследование.
Вот этот вывод самый внезапный, потому что субъективно год от года ощущение что начало весны очень разно.
Через модуль идентификации, или загружая каждое наблюдение отдельно? Если второе, то советую поглядеть на первый вариант -- там очень удобно и сделать выборку, и заполнить поля при помощи хоткеев.
Спасибо. Я очень рад, что кому-то это показалось интересным!
Правильно, наверное, будет сказать, что просто данных недостаточно для того, чтобы почувствовать значимую разницу. Например, за 2022 год загружено всего одно наблюдение с семенами. А наблюдения в пиковые дни включены в проекты вроде "City Nature Challenge" или "конкурс юных натуралистов", т.е. биоблицы вносят больший вклад в данные, чем погода. Может, это всё и можно как-то учесть, но я, честно признаться, не имею опыта анализа данных.
Всё через вкладку идентификации. Хоткеи я освоил, но основной тормоз — ждать подгрузки фотографий наблюдения. Не знаю, у меня ли проблемы с интернетом, или iNat их всегда так медленно отдаёт.
Кроме того, серьёзной проблемой оказалось, что штатный экспортёр iNat не позволяет выгрузить наблюдения с полями аннотаций. Вообще никак. Возможно, их можно выгрузить через API или где-то есть готовые сторонние решения, но я не разобрался, и собрал данные вручную. Просто выставлял фильтр на каждую декаду года и выписывал количество наблюдений.
Отфильтровать по полям аннотаций, или получить цсв с аннотациями?
Второе да, не умеет. А первое вполне можно:
https://www.inaturalist.org/observations/export?verifiable=true&page=1&spam=false&term_id=12&term_value_id=14&place_id=139356&user_id=&project_id=&swlng=&swlat=&nelng=&nelat=&lat=&lng=&radius=&taxon_id=56222
О, значит можно выгрузить только наблюдения, помеченные определённой аннотацией. Отлично, большое спасибо!
Можно, да. Самый простой способ -- на наблюдении с нужной аннотацией можно нажать на её название, в меню выбрать "наблюдения с с этой аннотацией и этим значением", после чего выбрать всё остальное и экспортировать из диалога "фильтры".
А ещё есть вот такой вот сваггер с информацией по полям API, https://api.inaturalist.org/v1/docs/#/Observations/get_observations. Можно подсматривать чтоб узнать что оно может и в каком формате ожидает данные.
新增評論